使用耳温枪测量体温前，应避免剧烈运动或在阳光下暴晒。拿出耳温枪打开电源，随后装上耳套，轻拉住受测人的耳朵，将测温头插入耳道，按着测温钮持续一秒钟就可以进行测温。如果耳温枪位置放置正确的话，耳温枪会发出正确鸣响，体温也会显示于屏幕上。
耳温枪通常使用热电堆传感器，此传感器包含了上述的光学系统、光电探测器—热电堆、热敏电阻。通过热电堆传感器，检测人体鼓膜的远红外6~15μm的辐射强度。这一测量结果是相对量，即所得结果与被测物的辐射强度和热电堆本身的温度相关。而热敏电阻则用于测量热电堆本身的温度。通过计算辐射强度及热电堆本身的温度，即可得到被测物的温度。
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